Strain

Genotype (D)

DCO /essentiality

(-/+)

1- mutants of ku-ligD-recA

M. smegmatis    1.1

DligD

DCO / -

1.2

Dku

DCO / -

1.3

DrecA

DCO / -

1.4

DligD-Dku

DCO / -

1.5

DligD-DrecA

DCO / -

1.6

Dku-DrecA

DCO / -

1.7

DligD-Dku-DrecA

DCO / -

1.8

DrecBCD

DCO / -

1.9

DligD-Dku-DrecBCD

DCO / -

1.10

DrecBCD-DrecA

DCO / -

1.11

DligD-Dku-DrecBCD-DrecA

DCO/-

2- mutants of ligC1-ligC2-P2

M. smegmatis 2.1

DligC1

DCO / -

2.2

DligC1-DligC2

DCO / -

2.3

Dprim2 (P2)

DCO / -

2.4

DligC1-DligC2-Dprim2 (P2)

DCO / -

2.5

DligC1-DligC2-Dprim2 (P2)-DligD-Dku

DCO/-

2.6

DligC1-DligC2-DrecA

DCO / -

2.7

DligC1-DligC2-Dprim2(P2)-DrecA

DCO / -

                   2.8

DligC1-DligC2-DKu-DligD

DCO/-

2.10

DKu-DligDDPrim2

DCO/-

2.11

DKu-DligDDligC1

DCO/-

2.12

DKu-DligC1DligC2

DCO/-

2.13

DligDDligC1DligC2

DCO/-

3- mutants of ligA

M. smegmatis  3.1

DligA-PamiligAms

DCO

Hyg

3.1A

DligA-PtetligAms

DCO

Tet

3.2

DligA-PamiligAtb

DCO

Hyg

3.3

DligA-PamiligAec

DCO

Hyg

3.4

DligA-PamiligT4

DCO

Hyg

3.5

DligA –PamiligA1str

DCO

Hyg

3.6

DligA-PamiligBstr

DCO

Hyg

3.7

DligA-PamiligAmsDligC1-DligC2-Dprim3(P2)

DCO

Hyg

3.8

DligA-PamiligAmsDprim2 -Dprim3-DligC1-DligC2

DCO / -

3.9

DligA-PamiligAms Dprim2-Dprim3-DligC1-DligC2 -DligB

DCO/-

3.10

DligA-PamiligT4-DligB

DCO/-

3.11

DligA-PamiligT4-DligB-DligD

DCO/-

3.12

DligA-PamiligBstr-DligB-DligD-Dku -DligC1-DligC2

DCO/-

3.13

DligA-PamiligT4-DligB-DligD-Dku

DCO/-

3.14

DligA-PamiligT4-DligB-DligD-Dku -DligC1-DligC2

DCO/-

4- mutants of disA-radA

M. smegmatis  4.1

DdisA

DCO/-

4.2

DradA

DCO / -

4.3

DdisA-DradA

DCO / -

4.4

DradA-DrecA

DCO/-

4.5

DdisA-DradA-DrecA

DCO/-

4.6

DradA-DrecBCD

DCO/-

M. tuberulosis  DNA repair                     4.7

ΔRadA (Rv)

DCO

4.8

ΔDisA (Rv)

DCO-

4.9

Δ(Ku,ligD)Rv

DCO

4.10

Δ(Ku,ligD,RecAHYG) (Rv)

DCO

4.11

ΔRecAHYG (Rv)

DCO

4.12

Δ(Ku,ligD,RadA) (Rv)

DCO/-

5- mutants of prim 1- 4

 M. smegmatis 5.1

Dprim3

DCO / -

M. smegmatis 5.2

Dprim3-DligD

DCO / -

M. smegmatis 5.3

Dprim3-DligD-Dku

DCO / -

M. smegmatis 5.4

Dprim3-DligC1-DligC2-Dprim2

DCO / -

M. smegmatis 5.5

Dprim3-DligC1-DligC2-Dprim2-DligD-Dku

DCO / -

M. smegmatis 5.6

DligC1-DligC2-DligD

DCO / -

M. smegmatis 5.7

DligC1-DligC2-Dku

DCO / -

M. smegmatis 5.8

Dprim4

DCO / -

M. smegmatis 5.9

Dprim3Dprim4

DCO / -

M. smegmatis 5.10

Dprim3Dprim4DligD

DCO / -

M. smegmatis 5.11

Dprim3Dprim4DligDDku

DCO / -

M. smegmatis 5.12

Dprim3-Dprim4-DligC1-DligC2-Dprim2

DCO / -

M. smegmatis 5.13

Dprim3-Dprim4-DligC1-DligC2-Dprim2DligDDku

DCO / -

M. smegmatis 5.14

Dprim2-Dprim3-Dprim4-DligD

DCO/-

M. smegmatis 5.15

Dprim2-DligD

DCO/-

M. smegmatis 5.16

Dprim2-Dprim3 -DligD

DCO/-

M. smegmatis 5.17

DdnaG-PamidnaGms

DCO/+

M. smegmatis 5.18

DdnaG-PamidnaGmt

DCO/+

6- mutants of ligB

M. smegmatis 6.1

DligB

DCO

M. smegmatis 6.2

DligBDligA-PamiligAms

DCO

M. smegmatis 6.3

DligBDligA-PamiligAmsDligC1-DligC2-Dprim2

DCO

M. smegmatis 6.4

DligB-DligC1-DligC2-Dprim2Dprim3-

DCO

M. smegmatis 6.5

DligB-DligC1-DligC2-Dprim2Dprim3-DligDDku

DCO

M. smegmatis 6.6

DligB-DligC1-DligC2-DligD-Dku

DCO

M. smegmatis 6.7

DligB-DligC1-DligC2-DligD-Dku-PamiT4

DCO/Hyg+

7- mutants of parA

M. smegmatis 7.1

DparAMs

DCO /-

M. tuberculosis 7.2

DprpR Mtb

DCO /-

8- mutants of RNA degradosome

M. tuberculosis 8.1

Drnj

DCO /-

M. tuberculosis 8.2

Dpnp+pJFR19::pnp

DCO /Km+

M. tuberculosis 8.3

DrhlE+pKW08::rhlE-eGFP

DCO /Hyg+

9 – mutants of TCSS

M. smegmatis 9.1

Δmsmeg0432

DCO / -

M. tuberculosis 9.2

Δrv0195

DCO / -

M. tuberculosis 9.3

Δrv0260

DCO / -

M. smegmatis 9.4

Δmsmeg1918

DCO / -

M. tuberculosis 9.5

ΔRv3220c

DCO / -

M. smegmatis 9.6

Δmsmeg2064

DCO/-

M. tuberculosis 9.7

ΔRV3143

DCO/-

M. tuberculosis 9.8

ΔRV2027c

DCO/-

M. smegmatis 9.9

Δmsmeg5241

DCO/-

M. smegmatis 9.10

Δmsmeg5784

DCO/-

M. tuberculosis 9.11

ΔRv2884

DCO/-

M. smegmatis 9.12

ΔMtrB+pMV306Km

DCO/+

M.smegmatis 9.13

ΔMtrA+pMV306Km

DCO/+

M.tuberculosis 9.14

ΔMtrB+MtrB::pacet w pJfr19

DCO/+

10 - M. tuberculosis - mutants of transcriptional agents and antitoxins

M. tuberculosis 10.1

ΔsiGRv0182c

DCO-

M. tuberculosis 10.2

ΔRvHigBA2

DCO-

11 - M. smegmatis - mutants of polA

M. smegmatis 11.1

ΔpolA+polA(own P) long MV306

DCO/ hyg/+

M. smegmatis 11.2

ΔpolA+polA (own P) short MV306

DCO/ Km/+

M. smegmatis 11.3

ΔPr2ΔpolA+polA (own P) long MV306

DCO/ hyg/+

M. smegmatis 11.4

ΔPr2ΔpolA+polA (own P) short MV306

DCO/ Km/+

M. smegmatis 11.5

ΔPr2 ΔPr3ΔpolA+polA (own P) long MV306

DCO/ hyg/+

M. smegmatis 11.6

ΔPr2 ΔPr3ΔpolA+polA (own P) short MV306

DCO/ Km/+

12 – mutants of  mycobacterial acylcarboxylases

M. smegmatis 12.1

DaccD6Ms

DCO(-)

M. smegmatis 12.2

DaccD6MsDkasBMs

DCO(-)

M. smegmatis 12.3

DaccD1Ms

DCO(-)

M. smegmatis 12.4

DaccD2Ms

DCO(-)

M. smegmatis 12.5

DaccD3Ms

DCO(-)

M. smegmatis 12.6

DaccD6;D1Ms

DCO(-)

M. smegmatis 12.7

DaccD6;D2Ms

DCO(-)

M. smegmatis 12.8

DaccD6;D3Ms

DCO(-)

M. smegmatis 12.9

DaccD6MsDkasBMsDaccD1Ms

DCO(-)

M. smegmatis 12.10

DaccD6Ms/accD4Ms(SCO)

DCO(-)/SCO(+)

M. smegmatis 12.11

DaccD6MsDkasBMs /accD4Ms(SCO)

DCO(-)/DCO(-)/SCO(+)

M. smegmatis 12.13

DaccD6Ms/accD5Ms(SCO)

DCO(-)/SCO(+)

13 – other mutants of metabolism of  mycobacterial cel wall

M. tuberculosis 13.1

DechA16Tb

DCO(-)

14 – mutants of LOS

M. marinum 14.1

DMMAR_2331

DCO (-)

M. marinum 14.2

DMMAR_2321

DCO (-)

M. marinum 14.3

DMMAR_2349

DCO (-)

M. marinum 14.4

DMMAR_4886

DCO (-)

15- mutants of RNase H

M. smegmatis 15.1

DrnhA

DCO

M. smegmatis 15.2

DrnhB

DCO

M. smegmatis 15.4

DrnhA+DrnhB

DCO

16 – mutants of IL 8  and SAA

M. tuberculosis 16.1

ΔAslA=ΔAtsG

DCO/-

M. smegmatis 7.1

ΔchoD

DCO / -

17 –M. smegmatis mutants of cholesterol degradation

M. smegmatis 17.1

ΔhsdD

DCO / -

M. smegmatis 17.2

Δ(hsdD,choD)

DCO / -

M. smegmatis 17.3

Δ(ksdD1,ksdD2)

DCO / -

M. smegmatis 17.4

ΔksdD2

DCO / -

M. smegmatis 17.5

DksdD1DksdD2-DchoD (tDCO)

DCO / -

M. smegmatis 17. 6

DksdD1

DCO / -

M. smegmatis 17. 7

Dech19

DCO / -

M. smegmatis 17. 8

Dfad19

DCO / -

18- M. tuberculosis mutants of cholesterol degradation

M. tuberculosis 18.1

Dhsd (DCO19)

DCO / -

M. tuberculosis 18.2

DchoD (DCO20)

DCO / -

M. tuberculosis 18.3

Dksd1D (DCO30)

DCO / -

M. tuberculosis 18.4

D(choD,hsdD)

DCO / -

M. tuberculosis 18.5

Dmce4

DCO / -

M. tuberculosis 18.6

DcytP450

DCO / -

M. tuberculosis 18.7

D(ech19,fad19)

DCO / -

M. tuberculosis 18.8

D(ech19,fad19, ksd1D)

DCO / -

M. tuberculosis 18.9

D(cytP450, ksd1D)

DCO / -

M. tuberculosis 18.10

D(mce4,ksd1D)

DCO / -