Instytut Chemii Bioorganicznej PAN
ICHB-1 LABORATORIUM ROZWOJU TESTÓW MOLEKULARNYCH I TECHNOLOGII SKRININGOWYCH
Zapraszamy do współpracy w zakresie projektowania, optymalizacji i realizacji wysokoprzepustowych testów molekularnych i komórkowych. Celem działania laboratorium jest stworzenie zintegrowanej, nowoczesnej infrastruktury badawczej dostosowanej do aktualnych potrzeb i trendów w dziedzinie poszukiwania nowych leków („drug discovery”).
Nasze laboratorium oferuje kompleksowe wsparcie w zakresie rozwoju testów i prowadzenia skriningów na etapie wczesnej identyfikacji związków biologicznie czynnych. Posiadamy zautomatyzowaną, modułową platformę wysokoprzepustowych testów przesiewowych (HTS, ang. High-Throughput Screening), która integruje najnowsze technologie transferu cieczy, obsługi płytek wielodołkowych, hodowli komórkowych oraz detekcji sygnału, co umożliwia prowadzenie badań w sposób elastyczny, skalowalny i powtarzalny.
Elementy systemu obejmują:
- dyspenser akustyczny do precyzyjnego i bezkontaktowego transferu cieczy w objętościach nanolitrowych (np. transfer bibliotek chemicznych),
- wielokanałowe dyspensery cieczy do szybkiego i precyzyjnego dozowania w testach biochemicznych i komórkowych oraz hodowlach HT,
- automatyczny inkubator umożliwiający prowadzenie wysokoprzepustowych hodowli komórkowych,
- zintegrowane czytniki płytek do detekcji sygnałów opartych na absorpcji, fluorescencji (w tym fluorescencji spolaryzowanej i czasowo-rozdzielczej) oraz bioluminescencji,
- kompletny system zarządzania pracą platformy HTS wraz z oprogramowaniem oraz infrastrukturą fizyczną (zamknięta klatka umożliwiająca kontrolę warunków środowiskowych).
Zakres usług obejmuje:
- klasyczne skriningi oraz opracowywanie testów biochemicznych (w tym profilowania biologicznego związków) opartych na detekcji widm absorpcji, fluorescencji (w tym polaryzacji i fluorescencji czasowo-rozdzielczej) oraz bioluminescencji,
- skriningi komórkowe z użyciem modeli 2D, 3D oraz kohodowli (m.in. z wykorzystaniem barwień komórkowych, monitorowania integralności błon, aktywności enzymatycznych, reporterów fluorescencyjnych i bioluminescencyjnych).
Oferta obejmuje również:
- opracowywanie testów – zarówno jedno-, jak i wieloparametrycznych,
- miniaturyzację oraz optymalizację warunków testowych,
- automatyzację i transfer protokołów do zrobotyzowanych systemów HTS,
- badania przesiewowe na dużą skalę (od 1 tys. do 100 tys. związków chemicznych),
- weryfikację trafień przy użyciu:
- testów ortogonalnych i kontrskriningów w celu potwierdzenia selektywności trafień,
- skriningów kombinatorycznych (wspieranych analizą z użyciem sieci neuronowych i algorytmów uczenia maszynowego),
- wsparcie w identyfikacji i walidacji celów molekularnych, badaniu mechanizmów działania związków oraz analizie interakcji ligand–cel molekularny,
- doradztwo oraz realizację badań wspierających procesy typu HIT-to-LEAD.
ICHB-2 LABORATORIUM BIOFIZYCZNEJ CHARAKTERYSTYKI ODDZIAŁYWAŃ MOLEKULARNYCH
Specjalizujemy się w badaniu interakcji pomiędzy celami molekularnymi a związkami aktywnymi (HITami), zarówno w klasycznych układach białko–mała cząsteczka, jak i w bardziej złożonych interakcjach: białko–DNA, białko–RNA, białko–białko oraz RNA–RNA.
W ramach infrastruktury POL-OPENSCREEN oferujemy kompleksowe wsparcie na kluczowych etapach wczesnego rozwoju leków – od walidacji związków aktywnych po ich optymalizację w fazie HIT-to-LEAD. Nasze zaawansowane podejście pozwala również na dekonwolucję efektów fenotypowych obserwowanych w skriningach komórkowych.
Zastosowanie nowoczesnych, wzajemnie uzupełniających się metod biofizycznych i bioanalitycznych zapewnia wysoką wiarygodność uzyskiwanych danych, ograniczając jednocześnie ryzyko fałszywie pozytywnych trafień. Nasza infrastruktura umożliwia prowadzenie badań w sposób efektywny, powtarzalny i zgodny z aktualnymi trendami w dziedzinie drug discovery.
Elementy systemu obejmują:
- aparat do pomiaru oddziaływań molekularnych metodą nanodźwigni wraz z wyposażeniem do przygotowania i przechowywania próbek,
- aparat do optymalizacji składu buforów dla cząsteczek biologicznych,
- aparat to izotermicznego miareczkowania kalorymetrycznego.
Zakres usług obejmuje:
- pomiary oddziaływań pomiędzy białkami a kwasami nukleinowymi (DNA/RNA) oraz białkami,
- analizę interakcji białko–małe cząsteczki (np. ligandy, leki, metabolity),
- określanie parametrów wiązania oraz kinetyki enzymatycznej,
- dobór oraz optymalizację składu buforów do badania cząsteczek biologicznych,
- przygotowanie i opracowanie testów molekularnych,
- wsparcie w molekularnej walidacji celów molekularnych, badaniu mechanizmów działania związków oraz analizie interakcji ligand–cel molekularny,
- przygotowanie płytek wielodołkowych do wysokoprzepustowych pomiarów biochemicznych i biofizycznych,
- walidację wyników otrzymanych z wykorzystaniem badań wysokoprzepustowych.
ICHB-3 LABORATORIUM BIOLOGII SYNTETYCZNEJ I SYNTEZY CHEMICZNEJ
Zapraszamy do współpracy w zakresie projektowania, optymalizacji i syntezy związków bioaktywnych. Celem Laboratorium Biologii Syntetycznej i Syntezy Chemicznej jest współtworzenie wysokowydajnej, w pełni zautomatyzowanej infrastruktury POL-OPENSCREEN do tworzenia związków bioaktywnych wybranych jako „HITy” w procesie skriningu wysokoprzepustowego. Laboratorium to jest również kluczowe dla badania oddziaływania HIT-cel molekularny, dla rozwoju modeli skriningowych oraz dla syntezy, semi-syntezy i biosyntezy związków bioaktywnych (głównie jako HITy), jak również dla sond molekularnych w procesie optymalizacji HIT-to-LEAD, w dziedzinie poszukiwania nowych leków („drug discovery”).
Elementy systemu obejmują:
- Najnowszej generacji system LCMS Q-TOF
- Kompaktowy HPLC z detekcją DAD i możliwością podłączenia ELSD oraz kolektorem frakcji
- Detektor ELSD wraz z kompresorem i akcesoriami połączeniowymi
- Inkubator z wytrząsaniem i chłodzeniem
- Komora laminarna do pracy z grzybami lub bakteriami
- Liofilizator laboratoryjny z akcesoriami, np. zamrażarka -80°C
Zakres usług obejmuje:
- Optymalizacja cząsteczek – „hit to lead” – chemoinformatyczne projektowanie oraz synteza chemiczna cząsteczek aktywnych biologicznie
- Biosynteza, biokataliza, semi-synteza dla związków trudnych do syntezy klasycznymi metodami
- Tworzenie bibliotek związków o potencjalnej aktywności biologicznej i dobór już istniejących bibliotek do testów bioaktywności
- Zautomatyzowane oczyszczanie, izolacja i analiza związków chemicznych – z materiału biologicznego lub reakcji enzymatycznych
- Wsparcie w badaniu mechanizmów działania związków oraz analizie interakcji ligand–cel molekularny,
- Doradztwo oraz realizację badań wspierających procesy typu HIT-to-LEAD.
Kontakt
Dr Dorota Jakubczyk
Telefon: +48 61 852 85 03
Numer wewnętrzny: 1165
Adres e-mail: djakubczyk@ibch.poznan.pl