Centrum Badań Molekularnych i Makromolekularnych PAN

Centrum Badań Molekularnych i Makromolekularnych Polskiej Akademii Nauk zaprasza zainteresowane podmioty do kontaktu w sprawie wyceny indywidualnych usług badawczych.

Realizujemy specjalistyczne usługi w zakresie analizy oddziaływań molekularnych oraz charakterystyki strukturalnej substancji i materiałów, ze szczególnym uwzględnieniem układów o znaczeniu biologicznym, takich jak białka, peptydy, ligandy czy cząsteczki farmaceutyczne. Zespół CBMiM PAN tworzą doświadczeni specjaliści prowadzący działalność badawczą i aplikacyjną na styku chemii, biofizyki i nauk o materiałach. Nasze laboratorium dysponuje nowoczesną infrastrukturą oraz doświadczeniem w realizacji projektów naukowych i wdrożeniowych. Wspieramy zarówno projekty akademickie jak i działania rozwojowe realizowane przez przemysł. Oferujemy elastyczny model współpracy – od rutynowych analiz po merytoryczne zaangażowanie w projekty badawczo-wdrożeniowe. Analizy realizujemy na materiałach dostarczonych przez klienta – zarówno substancjach biologicznych, związkach chemicznych, kompozytach, jak i materiałach funkcjonalnych.

Nasze analizy znajdują zastosowanie w badaniach nad substancjami aktywnymi biologicznie i materiałami złożonymi, opracowywaniu nowych leków oraz strategii drug-delivery, walidacji interakcji molekularnych, jak również w projektowaniu nowych materiałów funkcjonalnych. Usługi kierujemy do instytutów naukowych i uczelni, laboratoriów B+R, firm farmaceutycznych, biotechnologicznych i chemicznych, jak również jednostek inżynierii materiałowej, bioinżynierii i środowiskowej.

Zakres oferowanych usług

Nasze laboratorium wyposażone jest w nowoczesną, specjalistyczną aparaturę badawczą, umożliwiającą realizację zaawansowanych analiz molekularnych i biofizycznych.

Spektroskopia oscylacyjna (FT-IR/FT-Raman)

Oferujemy dostęp do nowoczesnej platformy badawczej FT-IR/FT-Raman, wyposażonej w specjalistyczną przystawkę do analizy białek i substancji bioaktywnych w roztworach wodnych.

Oprócz klasycznych zastosowań w chemicznej analizie strukturalnej, aparatura umożliwia:

• pracę w szerokim zakresie spektralnym przy użyciu technik transmisyjnych i odbiciowych, obejmującym zakres MIR, FIR i NIR,
• oznaczanie stężeń białek w roztworach wodnych, z wykorzystaniem czułych detektorów i krótkiej drogi optycznej, umożliwiające analizę także przy niskich stężeniach próbki,
• określanie konformacji i stabilności białek w warunkach fizjologicznych i ekstremalnych,
• śledzenie zmian strukturalnych podczas oddziaływania z ligandami lub pod wpływem środowiska (pH, temperatura, skład jonowy),
• ilościową analizę udziału struktur drugorzędowych (α-helisy, β-kartki, struktury nieuporządkowane),
• charakterystykę materiałów w zakresie terahercowym – analizę drgań sieciowych, polimorfizmu krystalicznego i przejść fazowych w ciałach stałych, w tym materiałach farmaceutycznych, biomateriałach, materiałach półprzewodnikowych i kompozytach,
• weryfikację stanu fizycznego substancji i określenie udziału form bezpostaciowych w lekach, suplementach, białkach liofilizowanych itp.,
• monitorowanie procesów dehydratacji i rehydratacji substancji farmaceutycznych i biologicznych, badania przejść fazowych,
• badania kompozytów i materiałów funkcjonalnych – także w warunkach zmiennej temperatury,
• analizę nanomateriałów, pigmentów i barwników, również przy niskim stężeniu,
• wykrywanie zanieczyszczeń w próbkach środowiskowych, materiałowych i biologicznych, analizę spektroskopową substancji nieznanego pochodzenia,
• badania spektroskopowe próbek silnie fluoryzujących – umożliwiając uzyskanie wysokiej jakości widm nawet w przypadku trudnych, naturalnie świecących materiałów (barwniki, pigmenty, ekstrakty roślinne, tkanki biologiczne).

Termoforeza Mikroskalowa – MST (Microscale Thermophoresis)

Dysponujemy zaawansowanym systemem analitycznym do badania oddziaływań molekularnych metodą Microscale Thermophoresis (MST). Technika ta umożliwia precyzyjną analizę interakcji biomolekularnych w roztworach wodnych, bez konieczności immobilizacji cząsteczek oraz przy zachowaniu warunków zbliżonych do fizjologicznych. Dzięki wysokiej czułości, niskim wymaganiom ilościowym i braku konieczności immobilizacji próbki, metoda sprawdza się zarówno w analizach punktowych, jak i badaniach przesiewowych.

Możliwe zastosowania MST obejmują:

• analizę oddziaływań molekularnych typu białko–ligand, białko–DNA/RNA, RNA–RNA, białko–białko oraz interakcje aptamerów,
• oznaczanie parametrów wiązania (Kd, EC50) oraz porównawczą ocenę powinowactwa cząsteczek,
• testowanie wpływu środowiska (pH, skład jonowy, obecność ligandów lub inhibitorów) na trwałość oddziaływań,
• pomiary w złożonych matrycach (frakcje komórkowe, surowice, bufory biologiczne),
• detekcję z wykorzystaniem naturalnej fluorescencji białek lub barwników zewnętrznych,
• screening związków czynnych oraz ocenę ich selektywności.

Interferometria Biowarstwy – BLI (Bio-Layer Interferometry)

Oferujemy możliwość prowadzenia precyzyjnych analiz oddziaływań molekularnych przy użyciu nowoczesnej technologii interferometrii BLI. Dzięki wysokiej czułości, brakowi konieczności znakowania próbki oraz możliwości prowadzenia pomiarów w czasie rzeczywistym, interferometria biofizyczna jest narzędziem o dużej wartości diagnostycznej, eksperymentalnej i aplikacyjnej, umożliwiając m.in.:

• analizę oddziaływań molekularnych typu białko–ligand, białko–białko, kwasy nukleinowe–ligand oraz antygen–przeciwciało,
• wyznaczanie kinetyki wiązań (parametry asocjacji i dysocjacji) oraz określanie trwałości kompleksów molekularnych,
• pomiary w naturalnym środowisku próbki – bez oczyszczania, np. w ekstraktach komórkowych, surowicach lub innych złożonych matrycach,
• badania wpływu warunków środowiskowych na procesy wiązania (pH, stężenia soli, obecność inhibitorów lub kofaktorów),
• weryfikację interakcji i selektywności ligandów w badaniach przesiewowych,
• ocenę powinowactwa i porównywaniu wariantów cząsteczek w procesie rozwoju leków lub projektowania bioaktywnych nanostruktur.

Kontakt

dr hab. inż. Marek Brzeziński
tel.: +48 (42) 68 03 328, 
e-mail: marek.brzezinski@cbmm.lodz.pl

prof. dr hab. Barbara Nawrot
tel.: + 48  (42) 68 03 248,
e-mail:  barbara.nawrot@cbmm.lodz.p